《福建医药杂志》是福建省卫生厅主管，中华医学会福建分会主办，福建省医学科学研究所承办的综合性医药学术期刊，1979年创刊，双月刊，国内外公开发行。本刊宗旨为贯彻预防为主、普及与提高相结合的办刊方针；立足本省，及时报道国内外医药卫生科研成果及防治疾病经验，反映其进展及水平，为省内外各级医药卫生技术人员提供学术交流平台。

收录情况/影响因子 国家新闻出版总署收录　本刊1992年获福建省首届优秀科技期刊二等奖；
1996年获福建省第二届优秀科技期刊一等奖；
1997年获华东地区优秀期刊奖，同年获全国优秀科技期刊三等奖；
2007，2008年连续获得福建省科协优秀科技期刊一等奖。
1997年上网以来，相继成为中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，中国期刊网中国学术期刊光盘版入编期刊，中国生物医学文献数据库收录期刊，万方数据-数字化期刊群入网期刊，中国核心期刊（遴选）数据库来源期刊，中文科技期刊数据库来源期刊；
2001年被国家新闻出版署、国家科技部评为中国期刊方阵双效期刊。

主要栏目有论著、临床研究与报道、实验研究、综述与讲座、预防医学、检验与临床、诊疗技术、药物与临床、中西医结合、医院管理、护理、基层医生园地等。