《分子植物育种》(ISSN1672－416X，CN46－1068/S)是由国家科技部批准，国家新闻出版署核准的刊物，由海南省科学技术协会主管，海南省生物工程协会主办，公开发行的单月刊科学期刊。《分子植物育种》由华中农业大学张启发院士任主编，北京大学朱玉贤院士、福建农林大学吴为人博士和海南省热带农业资源研究所所长方宣钧博士任执行主编。

《分子植物育种》Online Publishing in Advance 印刷版数字优先出版，是以《分子植物育种》印刷版期刊录用稿件为出版内容，先于印刷版期刊出版日期的在线出版模式。

《分子植物育种》“立足国内，面向国际”，是一份为转基因育种、分子标记辅助育种及常规育种服务的国际化科学杂志。也是中国唯一的一份以育种为名的科学杂志。围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林草等，刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文报道。本刊按国际标准编排，题目摘要、图表和引用文献等均实行中英文对照。

《分子植物育种》是北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》(2011年版)之核心期刊、中国科学技术信息研究所的中国科技论文统计源期刊之核心期刊；是中国科学院文献情报中心的中国科学引文数据库(CSCD)来源期刊，也被中国知网的中国期刊全文数据库(CJFD)、维普的中文科技期刊数据库、万方公司的中国核心期刊(遴选)数据库以及中国生物学文献数据库(CBA)收录。本刊被美国化学文摘(CA)、国际农业与生物科学研究文摘(CABI)和台湾华艺数据库(TEPS)等境外数据库收录。