《敦煌研究》期刊由敦煌文物研究所（后来的敦煌研究院）创办于二十世纪八十年初，于1981年和1982年出版了试刊第一期和第二期，1983年正式创刊。

1986年，《敦煌研究》作为季刊定期公开发行。2002年以后改为双月刊发行，每一期为120页，约20万字，为国内外学术界及时地提供新成果、新资料、新信息。至2006年底为止，本刊出版正刊100期，特刊7期，共发表敦煌学相关的各类文章2294篇，其中包括石窟艺术与考古方面论文696篇，历史文献方面论文867篇，石窟文物保护类论文187篇，其它相关资料、综述及信息稿件544篇。

这些文章涉及到敦煌学的所有专业，除了敦煌学领域，还对中国佛教考古、美术史研究、历史研究、古代汉语、古代民俗学、古代科技、音乐舞蹈研究文物保护研究、等领域产生了深远的影响，成为许多相关专业的必备参考书。

栏目:
折叠 石窟考古与艺术
本栏目主要刊发以敦煌石窟为主兼及中外石窟考古与艺术方面的研究成果。内容分为考古和艺术两个方面，石窟考古包括石窟的分期断代、内容考释等，石窟艺术主要是对石窟中雕塑、壁画等艺术形象进行美术史和美学方面的研究。

折叠 敦煌文献

刊布以敦煌藏经洞发现的文献为主兼及丝绸之路沿线发掘的文献资料的研究成果。包括对其整理、校勘、辑佚、内容考释、文献定名、文书缀合、文书目录公布、校订其他文献，分析文献价值、特点，对各种文献版本的鉴定、辨伪、考证和依据文献考证古遗址等。

折叠 敦煌语言文学
刊发敦煌文献中语言文学方面的研究成果。语言学方面的研究涉及到汉语音韵、训诂、校勘、俗字考证、修辞研究、非汉语语料（藏文、回鹘文、梵文等）研究等；文学方面涉及到俗文学研究、宗教文学研究、作品集研究、文学理论研究、文学欣赏等。

折叠 敦煌史地
刊发敦煌地区以及丝绸之路沿线历史、地理研究成果。研究领域涉及到敦煌地方史、中古社会史、民族关系史、历史地理考证、长城残垣、烽燧遗迹及丝绸之路与中外文化关系史等。

折叠 石窟保护
刊发敦煌石窟以及其他石窟和古遗址保护方面的科研成果。研究自然因素、人为因素和自身的病变对壁画、洞窟、雕塑、石窟岩体、木构建筑和古遗迹的影响、破坏，应用物理性能实验、化学分析和计算机数字化信息技术等手段对古文物进行科学保护。

折叠 敦煌民俗
通过敦煌文献、敦煌石窟艺术及相关资料研究中古时期敦煌地区人民的衣食住行、婚丧嫁娶、社交礼仪、民间信仰、娱乐游戏和时令节气等与人民日常生活密切相关的风俗习惯。

折叠 敦煌古代科技
刊发对敦煌文献及敦煌石窟中所包含的中国古代科技领域的研究成果。研究范围涉及到古代医学（药方）、算术、冶炼（炼丹术）、天文学、造纸术、印刷术、建筑、纺织、酿酒、水利工程、手工业等。