《杭州师范大学学报》分社会科学版和自然科学版，由杭州师范大学学术期刊社负责。《杭州师范大学学报（社会科学版）》是人文社科类综合性学术期刊，双月刊，单月出版，先后入选CSSCI来源期刊、全国中文核心期刊，连续四届被评为全国百强社科学报；《杭州师范大学学报（自然科学版）》是自然科学类综合性学术期刊，双月刊，单月出版，现为美国《化学文摘》(CA)、波兰《哥白尼索引》(IC)等国内外检索系统收录期刊。